Il y a environ 50 sources d’eau chaude naturelles le long du fleuve Kuma. Hitoyoshi est située dans ce qui fut, il y a des millions d’années, un lac au cœur de la zone volcanique entre le Mont Aso et le Mont Sakurajima. Le magma de cette chaîne volcanique chauffe les eaux souterraines qui jaillissent en surface et alimentent les sources thermales naturelles de Hitoyoshi. Les eaux proviennent d’une profondeur qui varie entre 150 et plus de 500 mètres sous terre. Certaines eaux thermales sont incolores, inodores et alcalines.

D’autres eaux de sources chaudes contiennent des éléments carbonés de sodium et d’hydrogène. Les sources chaudes de Hitoyoshi sont uniques car elles ne dégagent pas d’odeur de soufre ni de vapeur. La température de l’eau varie, selon la source, entre 40℃ et 50℃. Un texte écrit en 1492 rapporte que le seigneur féodal Tametsugu (le douzième daimyô du clan Sagara) se baigna dans les sources chaudes de Hitoyoshi, après s’être rendu au sanctuaire pour prier. S’en retournant au château de Hitoyoshi, il s’arrêta pour se baigner. Il y écrit un poème reflétant ses impressions sur la source chaude, qui fut archivé par la suite par un scribe. Il y a une centaine d’années, la ligne de chemin de fer Hisatsu fut mise en service et la mode des promenades en bateau sur le fleuve Kuma s’imposa progressivement. À peu près à la même époque, Suiranro construisit des infrastructures attenantes aux eaux thermales. Grâce à la grande popularité des sources d’eau chaude naturelles de Suiranro, d’autres installations virent rapidement le jour à de nombreux endroits de Hitoyoshi. Après avoirs établi une trentaine de sources thermales, la ville fut connue sous le nom de zone Hitoyoshi Onsen. Il existe aujourd’hui une trentaine d’installations thermales ouvertes à la baignade. Ces sources sont appelées collectivement «eaux de beauté» en raison des nombreux bienfaits que leurs eaux ont pour la peau.